Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNB1P20700 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms