Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms