Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAV1P15498 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAV1P15498 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAV1P15498 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAV1P15498 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms