Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms