Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms