Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF6O75683 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF6O75683 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF6O75683 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF6O75683 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF6O75683 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF6O75683 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF6O75683 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF6O75683 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF6O75683 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF6O75683 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF6O75683 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF6O75683 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF6O75683 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF6O75683 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF6O75683 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms