Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG13O75143 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG13O75143 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG13O75143 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG13O75143 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms