Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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