Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTIFO43310 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms