Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNMO15061 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNMO15061 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNMO15061 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNMO15061 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNMO15061 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNMO15061 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNMO15061 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNMO15061 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNMO15061 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNMO15061 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
SYNMO15061 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
SYNMO15061 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNMO15061 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNMO15061 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms