Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

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Length 2,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AGRNO00468 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AGRNO00468 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AGRNO00468 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AGRNO00468 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AGRNO00468 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AGRNO00468 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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