Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms