Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN3E7EW58 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms