Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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