Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms