Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms