Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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