Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL3Q9UKT7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms