Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms