Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms