Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf78Q9NZ63 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms