Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCIQ9NVI1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms