Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00846Q9NV44 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms