Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms