Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP8A2Q9NTI2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms