Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms