Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms