Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX4Q9H1E5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms