Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms