Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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