Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AKAP9Q99996 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AKAP9Q99996 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms