Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms