Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCT8L2Q96SF2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms