Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms