Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD27Q96NW4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms