Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms