Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms