Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRF1Q92994 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRF1Q92994 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms