Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC191Q8NCU4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC191Q8NCU4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms