Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms