Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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