Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SVBPQ8N300 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms