Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms