Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms