Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms