Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATL3Q6DD88 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms