Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms