Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms