Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR2Q2VWA4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms