Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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